Bruker tobulina vienos ląstelės proteomikos ir imunopeptidomikos našumą

FILADELFIA – (BUSINESS WIRE) – 21-ojoje metinėje JAV HUPO konferencijoje „Bruker Corporation“ (Nasdaq: BRKR) pristatė reikšmingus 4D-Proteomics™ našumo, programinės įrangos ir taikymo patobulinimus, suteikiančius gilesnių biologinių įžvalgų.

250 pikogramų K562 ląstelių mėginiai, atitinkantys vienos ląstelės proteomikos (SCP) reikalavimus, parodė daugiau nei 20% padidėjimą peptidų identifikacijoje su pirmaujančiu sekos aprėpties lygiu („Spectronaut 19.6“ apdorojimas be bibliotekų ir be „match between runs“) (Grafinė iliustracija: Business Wire).

A. AIP technologija timsTOF Ultra 2: geresnis peptidų ir baltymų identifikavimas vienos ląstelės proteomikoje ir imunoproteomikoje (dar vystoma technologija)

Naujoji AIP technologija leidžia itin efektyviai perkelti jonus iš susidūrimo kameros į ortogonalinį TOF analizatoriaus pagreičio regioną timsTOF Ultra 2 masių spektrometre. Vienos ląstelės proteomikai svarbiam 250 pg kiekiui AIP įgalina daugiau nei 15% padidėjimą baltymų identifikacijoje ir daugiau nei 20% peptidų identifikacijoje, užtikrinant didelę sekos aprėptį. Panašūs patobulinimai stebimi ir imunoproteomikoje.

Bruker planuoja pristatyti naująją AIP technologiją timsTOF Ultra 2 sistemoje ASMS 2025 konferencijoje, su galimybe ją atnaujinti lauko sąlygomis.

B. DeutEx: nauja programinė įranga vandenilio-deuterio mainų (HDX)-MS analizei

DeutEx – tai programinė įranga, kurią sukūrė Čekijos mokslų akademijos mokslininkas Petr Novák, skirta vandenilio-deuterio mainų masės spektrometrijos (HDX-MS) analizei. Dabar ši programinė įranga integruota į Bruker proteomikos ekosistemą, palaikant timsTOF, MRMS ir MALDI-TOF sistemas.

Dr. Petr Novák, Struktūrinės biologijos ir ląstelių signalizacijos skyriaus vadovas Čekijos mikrobiologijos institute Prahoje, sakė: „Džiaugiamės, kad Bruker integruoja DeutEx į HDX-MS analizę. Su Bruker palaikymu ir tolesne plėtra, DeutEx taps plačiai naudojama priemone, leidžiančia giliau tyrinėti baltymų ir jų kompleksų struktūrines bei dinamines savybes, teikdama naujas įžvalgas biofarmacijos ir struktūrinės biologijos srityse.“

C. OmniScape 2025b programinė įranga: top-down proteomikos pažanga

Naujoji OmniScape 2025b versija suteikia 10 kartų didesnį de novo sekos nustatymo našumą, leidžia aptikti sutrumpintus variantus ir pateikia išsamius sekų anotacijos duomenis. Ji taip pat leidžia integruoti sekos žemėlapius iš skirtingų MSn lygių (MS2 ir MS3), įskaitant naują MALDI T³ sekvenavimą.

Profesorius Julia Chamot-Rooke iš Pastero instituto Paryžiuje, Prancūzijoje, teigė: „OmniScape yra pažangiausia programinė įranga mano laboratorijoje, skirta top-down MS/MS baltymų spektrų analizei, nepriklausomai nuo taikomo fragmentacijos metodo.“

Profesorius Francisco Alberto Fernandez-Lima iš Floridos tarptautinio universiteto Majamyje, JAV, pridūrė: „Mūsų laboratorija intensyviai naudoja OmniScape de novo ir top-down baltymų-PTM sekų patvirtinimui iš ExD ir UVPD duomenų rinkinių, gautų naudojant timsTOF ir FT-ICR MS instrumentus. OmniScape yra patogi vartotojui ir leidžia interaktyviai priskirti ir patvirtinti proteoformų fragmentus, įskaitant kintamus aminorūgščių modifikacijas, m/z vidinę kalibraciją bei MS-BLAST paiešką duomenų bazėse.“

D. Patobulinta Bruker ProteoScape apdorojimo sistema ir išplėstos glikoproteomikos galimybės

ProteoScape™ V.2025c apima Spectronaut® ir GlycoScape™ programinės įrangos naujinius. Spectronaut v.19.6 siūlo dar didesnį našumą, patobulintą kiekybinę imputaciją ir PTM stechiometrijos skaičiavimus. GlycoScape v.2025c dabar leidžia pritaikyti modifikacijas, įskaitant pasirinktus glikanų statybinius blokus ir ženklintus glikanus.

Kartu su Agilent AssayMAP Bravo® pagrindu veikiančiu glikoproteomikos darbo eigos sprendimu, tai leidžia atlikti automatizuotą, didelės apimties glikoanalizę ir padidina identifikuojamų glikopeptidų kiekį 6–10 kartų, leidžiant detalią glikoformų analizę naudojant timsTOF sistemas su operatyviu GlycoScape apdorojimu.

Dr. Christopher Adams, Proteomikos direktorius iš „Rezo Therapeutics“ San Fransiske, JAV, sakė: „Mūsų timsTOF HT sinchronizuotas su ProteoScape platforma, ir mane sužavėjo greitis, kuriuo pristatomos naujos versijos ir funkcijos.“

E. TwinScape – debesijos pagrindu veikiantis, dirbtiniu intelektu įgalintas proteomikos kokybės stebėjimo sprendimas

TwinScape – unikali debesijos pagrindu veikianti AI įgalinta programinė įranga, kuri šiuo metu stebi šimtus klientų sistemų, įskaitant nanoElute® skysčių chromatografus ir visą timsTOF seriją.

Dr. Julian Langer, Masės spektrometrijos laboratorijos vadovas Makso Planko Biochemijos ir Smegenų tyrimų institute Frankfurte, Vokietijoje, pasidalijo savo patirtimi: „TwinScape tapo puikiu papildymu mūsų HeLa/iRT pagrindu veikiančioje kokybės kontrolės sistemoje ir yra neatsiejama mūsų įprastų QC patikrų dalis. Įžvalgos ir nuolatinė stebėsena, kurią suteikia TwinScape, žymiai pagerino mūsų darbo efektyvumą – ne tik padėdama išspręsti potencialias problemas dar prieš joms atsirandant, bet ir įgalinant proaktyvų techninį klientų aptarnavimą.“

Apie „Bruker Corporation“ – postgenominio amžiaus lyderė (Nasdaq: BRKR)

Bruker įgalina mokslininkus ir inžinierius daryti proveržius postgenominiuose atradimuose ir kurti naujas taikomąsias technologijas, kurios gerina žmonių gyvenimo kokybę. Bruker siūlo aukštos kokybės mokslinius instrumentus bei analitinius ir diagnostinius sprendimus, leidžiančius tyrinėti gyvybę ir medžiagas molekuliniame, ląsteliniame ir mikroskopiniame lygyje.

Daugiau informacijos rasite adresu: www.bruker.com.

Kontaktai žiniasklaidai:
Petra Scheffer
Bruker Daltonics Marketing Communications
T: +49 (421) 2205-2843
E: petra.scheffer@bruker.com

Kontaktai investuotojams:
Joe Kostka
Investor Relations Director
T: +1 (978) 313-5800
E: Investor.Relations@bruker.com